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原子

原子情報 タブでは、結晶に含まれる原子の情報を表示・設定します。上部のリストに原子の一覧が表示され、各原子をクリックすると詳しい情報が下部に表示されます。

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原子を編集したら、Add または Replace ボタンを押してください。押さないと原子情報がリストに保存されません。

原子リストの操作

  • Add — 設定した原子をリストに新規追加します。
  • Replace — 設定した原子を現在選択中の原子と入れ替えます。
  • Up / Down — 選択した原子の順番を上下に移動します。
  • Delete — 選択した原子をリストから削除します。

元素と位置

  • Label — 原子のラベルを入力します。
  • Element — 元素を設定します。
  • X, Y, Z — 原子の分率座標を設定します。0 から 1 までの実数を入力します。1/2 や 2/3 のような分数も入力できます。
  • Occ — 占有率を 0 から 1 までの実数で指定します。

Origin shift では、プリセットボタンや任意の値で原点位置をシフトできます。

温度因子(Debye-Waller factor)

  • NotationUB を選択します。
  • Model — 等方性 (Isotropy) か異方性 (Anisotropy) を選択します。
  • 温度因子の各成分(B## または U##)を入力します。

散乱因子(Scattering factor)

原子散乱因子を計算する際の価数や同位体組成を設定します。

  • X-ray — X 線に対する弾性原子散乱因子の計算に用いる価数を選択します。パラメータは International Tables for Crystallography volume C に基づきます。
  • Electron — 電子線に対する弾性原子散乱因子の価数を選択します。パラメータは Peng (1998, Acta Cryst. A54, 481-485) に基づきます。
  • Neutron — 中性子の弾性散乱長を計算する同位体組成を選択します。Natural isotope abundance(天然存在比)または Custom isotope abundance(任意設定)を選べます。