回折線・結晶情報¶

メイン画面のツールバーから 回折線/結晶情報 アイコンをクリックすると、下図のようなサブウィンドウ（Crystal Parameter）が開きます。このウィンドウでは、回折ピークを表示したい結晶の種類や、回折ピークの表示方法を設定します。ウィンドウ下部には、結晶構造を検索・取り込みするための結晶データベースが組み込まれています。

ウィンドウは大きく次の 4 つの領域に分かれます。

領域	役割
回折線オプション（`Diffraction Peak Option`）	回折線の表示方法に関する設定
結晶リスト（`Crystal List`）	メイン画面と共有する結晶のチェックリスト
結晶情報（`Crystal Information`）	選択した結晶の詳細パラメータ（タブ切り替え）
結晶データベース（`Crystal database`）	AMCSD ベースの検索・取り込み

回折線オプション¶

回折線の表示に関する設定を行います。

回折線を重ねて表示（Show peaks over profiles）¶

プロファイルデータに重ねて回折線を表示するかどうかを選択します。

強度比を計算（Calculate intensity ratio）¶

構造データから回折強度（の比）を計算するかどうかを選択します。

Note

原子位置が入力されていない場合は、チェック状態にかかわらず強度は計算されません。原子情報の入力については原子情報タブを参照してください。

強度を変更可（Scalable intensity）¶

強度比を変えずに、回折線全体をスケーリングできるかどうかを選択します。

回折線を下に表示（Show peaks under profile）¶

プロファイルの下部に回折ピークを表示するかどうかを設定します。

ピーク高さ（Peak height）¶

プロファイル下部に表示するピークの高さをピクセル単位（pixel）で設定します。

近接するピークを結合（Combine adjacent peaks）¶

結晶学的には非等価でも、2θ が近い、あるいは全く同じになるピークの強度をまとめて表示するかどうかを選択します。

たとえば立方晶系では (333) 面と (115) 面は非等価であるにもかかわらず、全く同じ d 値を持つため観測上は重なってしまいます。このような場合、このチェックボックスをチェックすると、強度をまとめて表示できます。

項目	説明
角度閾値（`Angle threshold`）	どれくらい近いピークをまとめるかを角度（`°`）で指定します。
エネルギー閾値（`Energy threshold`）	エネルギー分散の場合に、まとめる範囲をエネルギー（`eV`）で指定します。

Tip

旧マニュアルでは閾値の単位をオングストロームと記載していましたが、現行版では横軸の種類に応じて角度（°）またはエネルギー（eV）で指定します。

弱いピークを非表示（Hide peaks below）¶

最強線と比べて低すぎるピークを消去するかどうかを選択します。最強線に対する比率（rel.%）で指定します。

ピーク指数を表示（Show peak indices）¶

回折線の指数（ミラー指数）を表示する対象を選択します。

選択肢	表示対象
`チェックした全ての結晶`（all checked crystals）	チェックしているすべての結晶
`選択した結晶のみ`（only selected crystal）	リストで選択している結晶のみ

結晶リスト¶

メイン画面の Profile チェックリストと同一の情報を表示します。チェックされている結晶は、メイン画面に回折線が表示されます。各行には、チェックボックス（Check）、描画色（PeakColor）、結晶名（Crystal）が表示されます。

上下矢印ボタン（↑ / ↓）¶

結晶の順番を変更します。

Note

1〜6 個目の行は状態方程式（EOS）のために予約されており、順番を変更できません。EOS については状態方程式を参照してください。

追加（Add）¶

右の結晶情報領域（後述）で設定した結晶を、リストに新規追加します。

更新（Replace）¶

右の結晶情報領域で設定した結晶を、現在選択されている結晶と入れ替えます。

削除（Delete）¶

現在選択されている結晶をリストから削除します。

全削除（Delete all）¶

すべての結晶をリストから削除します。

結晶情報¶

選択した結晶の詳細な情報を、タブで切り替えながら編集・表示します。主なタブは次のとおりです。

タブ	内容
`格子/対称性`（Basic Info.）	格子定数・結晶系・空間群などの基本情報
`原子情報`（Atom Info.）	原子の種類・占有率・座標・温度因子
`引用文献`（Ref.）	出典となる論文・著者などの文献情報
`状態方程式`（EOS）	圧縮・熱膨張を扱う状態方程式の設定

格子/対称性タブ¶

格子定数（a, b, c, α, β, γ）、結晶系、空間群といった基本情報を設定します。空間群を選ぶと、入力可能な格子定数や原子座標の自由度が自動的に制限されます。

Tip

格子定数の入力欄を右クリックすると、アプリ起動時（またはデータベースから取り込んだ時点）の値に格子定数を回復するメニューが表示されます。フィッティングなどで値を変えた後、元の参照値に戻したいときに便利です。

原子情報タブ¶

各原子の元素種、占有率、分率座標、等方／異方性温度因子などを設定します。ここに原子位置が入力されていると、強度比を計算で回折強度を計算できます。

引用文献タブ¶

結晶構造の出典となる論文名・雑誌名・著者などの文献情報を保持します。結晶データベースから取り込んだ構造には、この情報が自動的に設定されます。

状態方程式タブ¶

圧力・温度による格子定数の変化を扱う、結晶ごとの状態方程式（EOS）を設定します。主な入力項目は次のとおりです。

項目	説明
`Use EOS`	この結晶で EOS による圧力計算を有効化。
`T0` / `Temperature`	基準温度 / 測定温度。
`V0`	基準状態の単位胞体積。
`K0`, `K'0`	等温体積弾性率とその圧力微分。
等温式	`BM3`（3 次 Birch-Murnaghan, 既定）/ `BM4` / `Vinet` / `AP2` / `Keane`。
熱圧力	`Mie-Grüneisen`（既定。パラメータ \( \gamma_0, \theta_0, q \)）/ `T-dependence K0&V0`。

各式の数式と記号の定義は状態方程式を参照してください。

結晶データベース¶

2 万件以上の結晶構造について、検索および取り込み機能を提供します。このデータベースは American Mineralogist Crystal Structure Database（AMCSD）に基づいています。

引用について

この結晶データを使用する際は、http://rruff.geo.arizona.edu/AMS/amcsd.php をよく読み、次の文献を必ず引用してください。

Downs, R.T. and Hall-Wallace, M. (2003) The American Mineralogist Crystal Structure Database. American Mineralogist 88, 247-250.

テーブル¶

データベースに含まれている結晶が一覧表示されます。検索条件が入力されている場合は、その条件に合った結晶のみが表示されます。

テーブル中の任意の結晶を選択すると、その情報が結晶情報に転送されます。結晶リストに加えたい場合は、結晶リスト領域の 追加（Add）または 更新（Replace）ボタンを押してください。

検索オプション¶

検索条件を入力します。入力後は 検索（Search）ボタンを押すか、Enter キーを押してください。各条件はチェックボックスで有効・無効を切り替えられます。

名前（Name）¶

結晶の名称を入力します。

元素（Elements）¶

周期表（Periodic Table）ボタンを押すと別ウィンドウが開きます。ここで検索対象の元素を選択します。各元素のボタンは、押すごとに状態が切り替わります。

ウィンドウ上部のボタンで、全元素の状態を一括で切り替えられます。

ボタン	意味
`may or not include`	含んでいても含んでいなくてもよい（元素の制約をすべて解除します）
`must include`	必ず含む（指定した元素をすべて含む結晶のみが残ります）
`must exclude`	必ず含まない（指定した元素を 1 つでも含む結晶は除外されます）

Tip

散乱因子を無視（Ignore scattering factor）をチェックすると、散乱因子を考慮せずに検索を行えます。

文献（Reference）¶

論文名、雑誌名、著者名を入力します。

結晶系（Crystal System）¶

結晶系を指定して検索します。

格子定数（Cell Params）¶

格子定数と、許容する誤差を入力します。

d 値（d-spacing）¶

強度の強い結晶面の d 値（面間隔）と、許容する誤差を入力します。

密度（Density）¶

密度と、許容する誤差を入力します。