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結晶データベース

結晶データベース は、2つのデータソースから結晶構造を検索・インポートできます。AMCSDCOD のチェックボックスで切り替えます。

  • AMCSD : 内蔵の American Mineralogist Crystal Structure Database(約21,000件)。
  • COD : Crystallography Open Database。大きいファイルなのでインストーラーにはバンドルしておらず、初回利用時にデータベースファイルが自動でダウンロードされます。サーバーでファイルが更新された場合は、再ダウンロードを促されます。

これらのデータベースを使用する際は、以下の文献を引用してください。

AMCSD を使用する場合:

Downs, R.T. and Hall-Wallace, M. (2003) The American Mineralogist Crystal Structure Database. American Mineralogist 88, 247–250.

COD を使用する場合:

Gražulis, S. et al. (2009) Crystallography Open Database – an open-access collection of crystal structures. Journal of Applied Crystallography 42, 726–729.

Gražulis, S. et al. (2012) Crystallography Open Database (COD): an open-access collection of crystal structures and platform for world-wide collaboration. Nucleic Acids Research 40, D420–D427.

結晶データベース


キーボード・マウスショートカット

このウィンドウに修飾キーの組み合わせはなく、操作は通常のクリックが中心です。分かりにくい入力は以下のみです。

ショートカット 動作
F1 このページのオンラインマニュアルを開く
検索欄で ENTER データベース検索を実行(Search ボタンと同じ)
結果テーブルの行をクリック その結晶をメインウィンドウへ読込
周期表 ポップアップで元素をクリック フィルタを循環: 無視含む除外

→ 全ウィンドウの一覧は 21. キーボード・マウスショートカット を参照。


テーブル

結晶テーブル

データベースに含まれる結晶が表示されます。検索条件を入力している場合は、条件に合う結晶のみが表示されます。

テーブル中の結晶を選択すると、メインウィンドウの 結晶情報 に情報が転送されます。結晶リスト に追加するには リストへ追加 または 選択結晶と入れ替え ボタンを押してください。


検索オプション

検索オプション

検索条件を入力後、検索ボタンまたはEnterキーを押してください。

条件 説明
名前 結晶の名称
元素 周期表ボタンで元素選択ウィンドウを開く。各元素のボタンは「含んでもよい」「必ず含む」「必ず含まない」を切替
文献 論文名、雑誌名、著者名
結晶系 結晶系を選択
格子定数 格子定数と許容誤差
d値 強い回折のd-spacingと許容誤差
密度 密度と許容誤差

名前

結晶名のテキスト検索。部分一致可。

元素

周期表ボタンで元素選択ウィンドウを開きます。各元素ボタンは押すたびに以下の3状態を切り替えます。

  • 含んでもよい(デフォルト・グレー)
  • 必ず含む(緑)
  • 必ず含まない(赤)

ウィンドウ上部の 3 つのボタンで、すべての元素を一括で 3 状態のいずれかにリセットできます。

文献

論文タイトル・雑誌名・著者リストを対象としたテキスト検索。

結晶系

特定の結晶系(立方・正方・斜方・六方・三方・単斜・三斜)に絞り込みます。

格子定数検索

格子定数検索

目標の格子定数 a, b, c, α, β, γ と許容誤差を入力します。空欄はワイルドカード扱い。

d値

最強反射(または複数の強反射)の d-spacing と許容誤差を入力します。実験で回折ピーク位置のみが分かっている場合に有用。

密度

質量密度 (g/cm³) と許容誤差で絞り込みます。


関連項目