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Manual de ReciPro

Breve introducción

  • ReciPro es un software libre con licencia MIT que ofrece una gran variedad de cálculos cristalográficos y simulaciones de microscopía electrónica.
  • ReciPro se ha descargado más de 27.000 veces en total desde su publicación en GitHub (marzo de 2020) y es utilizado por numerosos cristalógrafos y microscopistas electrónicos.

Encontrar por objetivo

Objetivo Empezar aquí Pasos siguientes principales
Cargar un cristal y establecer su orientación Ventana principal Geometría de rotación, Apéndice A1. Sistemas de coordenadas
Examinar una estructura cristalina en 3D Visor de estructura Información de simetría
Calcular patrones SAED / XRD / PED / CBED Simulador de difracción SAED, Difracción de rayos X, PED, CBED
Calcular imágenes HRTEM / STEM Simulador HRTEM/STEM HRTEM, STEM
Simular patrones EBSD Simulación EBSD Trayectorias electrónicas, Apéndice A3. Cálculo de EBSD
Indexar reflexiones de difracción experimentales Spot ID v1, Spot ID v2 Simulador de difracción
Comprender las ecuaciones de la difracción dinámica Apéndice A3. Método de ondas de Bloch Cálculo dinámico, CBED, STEM, EBSD

Funciones

  • Full GUI : Todas las operaciones se realizan a través de una interfaz gráfica. La mayoría de las entradas/salidas de archivos admiten arrastrar y soltar.
  • Lista de cristales : Gestiona varios cristales a la vez; no es necesario abrir una ventana distinta para cada cristal.
  • Base de datos de grupos espaciales : Base de datos integrada que abarca los 230 grupos espaciales de las International Tables Volume A, además de 530 símbolos de Hall, con elementos de simetría, posiciones de Wyckoff y reglas de extinción. Los elementos de simetría y las posiciones generales pueden dibujarse como diagramas esquemáticos al estilo de las International Tables Vol. A (véase 2. Información de simetría).
  • Información atómica : Factores de dispersión (rayos X, electrón, neutrón), energías de rayos X característicos, proporciones isotópicas, etc. para los elementos H (1) – Cf (98).
  • Rotación flexible del cristal : Establece la orientación mediante índices de eje de zona/plano cristalino o arrastrando el ratón. Se admite la notación de Miller-Bravais (4 índices hkil) para los sistemas trigonal/hexagonal. El estado de rotación se sincroniza en todas las ventanas de simulación.
  • Simulación de difracción : Difracción electrónica cinemática y dinámica (método de ondas de Bloch), difracción de rayos X (incluidas las cámaras de precesión y de Laue por reflexión), difracción electrónica de precesión (PED) y difracción electrónica de haz convergente (CBED). Una simulación de portamuestras TEM vincula el patrón de difracción con los ángulos de inclinación del portamuestras.
  • Simulación HRTEM / STEM : Simulación de imágenes TEM de alta resolución con modelos de coherencia parcial; STEM con dispersión térmica difusa.
  • EBSD y trayectorias electrónicas : Simulación de patrones EBSD y simulación Monte-Carlo de trayectorias electrónicas (véase 8. Trayectorias electrónicas).
  • Indexación de reflexiones : Detección, ajuste e indexación automáticos de reflexiones de difracción a partir de imágenes experimentales (Spot ID v1/v2).
  • Macro : Macro con sintaxis de Python para automatizar operaciones (véase 20. Macro).
  • Tema claro / oscuro : La interfaz sigue un modo de color claro u oscuro seleccionable.

Requisitos del sistema

Elemento Mínimo Recomendado
SO Windows con .NET Desktop Runtime 10.0 (Windows on ARM64 compatible) Windows 11
GPU OpenGL 1.3 GPU externa con OpenGL 4.3
Memoria – 16 GB o más
CPU – 8+ núcleos (para cálculos dinámicos)

Windows on ARM (nativo, experimental) : En la página de versiones está disponible un paquete portable nativo ARM64 experimental (ReciPro-v.X_arm64.zip, self-contained — no requiere la instalación del .NET Runtime). Los paquetes x64 habituales también se ejecutan en Windows ARM64 mediante la emulación integrada. Consulte Solución de problemas para ver notas de configuración y limitaciones.

macOS (no oficial) : ReciPro solo es compatible oficialmente con Windows, pero se ha informado de que el paquete portable ZIP win-x64 se ejecuta en macOS (Apple Silicon) utilizando el contenedor de Wine Sikarugir combinado con el controlador OpenGL Mesa3D. En https://github.com/Ryo-fkushima/ReciPro_macOS_memo hay disponible una guía de configuración publicada por un usuario. Tenga en cuenta que esta vía no tiene soporte oficial y que algunos símbolos (Å, superíndices, flechas) pueden mostrarse incorrectamente. El ZIP ARM64 no se ejecuta en macOS + Wine, y se prevé que la vía actual de x64 + Rosetta 2 deje de funcionar a partir de macOS 28 (otoño de 2027) — consulte Solución de problemas para más detalles.

Cómo usar este manual

Este manual de GitHub Pages es actualmente la fuente de referencia. Use la navegación de la izquierda para explorar por capítulos, o use la búsqueda del encabezado para encontrar el nombre de una función o una etiqueta de la interfaz. Los antiguos manuales en PDF se conservan como referencia de archivo.

Inicio rápido

  1. Descargue e instale desde Releases.
  2. Seleccione un cristal de la lista integrada (~80 cristales). También puede importar archivos CIF o usar CSManager.
  3. Llame a las funciones desde el panel de la derecha: Visor de estructura, Estereograma, Simulador de difracción, Simulación HRTEM, etc.
  4. Gire el cristal arrastrando el ratón o introduciendo índices de eje de zona/plano.

Referencia

Y. Seto, "ReciPro: free and open-source multipurpose crystallographic software integrating a crystal operation interface and diffraction simulators," J. Appl. Cryst. 55, 397–410 (2022). https://doi.org/10.1107/S1600576722000139

Licencia

ReciPro se distribuye bajo la Licencia MIT.