Spot ID v2¶
Spot ID v2 ist die erweiterte Version von Spot ID mit verbesserter Reflexerkennung, verbesserten Fit-Algorithmen und einer leistungsfähigeren Indizierungs-Engine.
Tastatur- & Maus-Kurzbefehle¶
Die Reflexliste erstellen Sie direkt auf dem geladenen Bild. Der Bildbereich nutzt die standardmäßige Bildansicht-Navigation von ReciPro zum Verschieben/Zoomen; für die Reflexbearbeitung kommen die folgenden Kombinationen hinzu.
| Kurzbefehl | Aktion |
|---|---|
| F1 | Diese Seite des Online-Handbuchs öffnen |
| Linker Doppelklick auf das Bild | Einen Reflex an diesem Punkt hinzufügen (Peak-gefittet) |
| CTRL + linker Doppelklick | Einen Reflex hinzufügen und als direkten (000) Strahl markieren |
| Linksklick auf einen Reflex | Den nächstgelegenen Reflex auswählen |
| CTRL + Rechtsklick auf einen Reflex | Den nächstgelegenen Reflex löschen |
| CTRL + Pfeiltasten | Den ausgewählten Reflex um ein Pixel verschieben |
| Linksziehen / Mittelziehen (leerer Bereich) | Das Bild verschieben |
| Mausrad | Am Cursor hinein-/herauszoomen |
| Rechtsziehen eines Rahmens | In den ausgewählten Bereich hineinzoomen |
| Rechter Doppelklick | Herauszoomen |
| Doppelklick auf den Zeilenkopf eines Reflexes (Tabelle) | Auf diesen Reflex zoomen (×2) |
Mit CTRL+SHIFT+T im Hauptfenster wird dieses Fenster geöffnet/geschlossen.
→ Siehe 21. Tastatur- & Maus-Kurzbefehle für jedes Fenster auf einen Blick.
Menü „Datei“¶
Ein Beugungsbild öffnen/speichern. Das gleiche Laden per Drag & Drop wie bei Spot ID v1 wird unterstützt, und Gatan-DM3/DM4-Metadaten (Kameralänge, Wellenlänge, Pixelgröße) werden automatisch berücksichtigt.
Optik¶
Strahlungsquelle¶
Wählen Sie den Strahlungstyp (Röntgen / Elektron / Neutron) und stellen Sie die Energie oder Wellenlänge ein.
Kameralänge / Pixelgröße¶
Die Kameralänge (mm) und die Detektor-Pixelgröße (mm oder nm⁻¹). Wenn eine Gatan-DM-Datei geladen wird, werden diese Werte aus dem Dateikopf übernommen.
Reflexinformation¶
- Detect & Fit Spots: Automatische Reflexerkennung mittels lokaler Maxima und Untergrundabzug.
- Number: Die maximale Anzahl der zu erkennenden Reflexe.
- Nearest neighbour: Der minimale Abstand (px), der zwischen erkannten Reflexen zulässig ist. Peaks, die enger beieinander liegen, werden zusammengeführt, um eine Doppelerkennung desselben Reflexes zu verhindern.
- Fitting range (radius): Der Radius (px) des kreisförmigen Bereichs, der zum Fitten des Peaks jedes Reflexes verwendet wird. Pixel innerhalb dieses Kreises werden mit einer Pseudo-Voigt-Funktion gefittet.
- Apply to All: Setzt den Fit-Radius jedes Reflexes auf den aktuellen Wert von Fitting range (radius).
- Delete spot / Clear spots: Einzelne oder alle erkannten Reflexe entfernen.
- Copy to clipboard: Reflexpositionen und -intensitäten in die Zwischenablage kopieren.
- Details of the spot: Wenn aktiviert, öffnet sich ein Fenster mit detaillierten Informationen zum aktuell ausgewählten Reflex.
Index¶
- Identify Spots: Führt den Indizierungsalgorithmus aus, um den am besten passenden Kristall und die Zonenachse zu finden.
- Acceptable error: Legt die akzeptable Abweichung im Netzebenenabstand und Winkel für eine Übereinstimmung fest.
- Ignore prohibited reflections: Wenn aktiviert, werden durch Schraubenachsen und Gleitspiegelebenen verbotene Reflexe bei der Suche nach der Zonenachse als nicht zwingend erfüllt behandelt.
- Single Grain / Multiple Grains: Suche nach einer einzelnen Orientierung (Einkristall) oder nach mehreren Orientierungen (ein polykristalliner / Mehrkorn-Bereich). Für mehrere Körner legt Max. num. of grains die Obergrenze für die Anzahl der zu suchenden Körner fest.
- Results: Die besten Übereinstimmungen werden mit Kristallname, Zonenachse [uvw] und den einzelnen Reflexindizes (hkl) angezeigt.
Verbesserungen gegenüber v1¶
- Bessere Rauschbehandlung bei der Reflexerkennung.
- Robustere Fit-Algorithmen mit mehreren Profilformen.
- Schnellere Indizierung mit optimierten Suchalgorithmen.
- Unterstützung für überlappende Reflexe und Satellitenreflexe.