Spot ID v2¶

Spot ID v2 è la versione potenziata di Spot ID con rilevamento degli spot migliorato, algoritmi di fitting perfezionati e un motore di indicizzazione più potente.

Scorciatoie da tastiera e mouse¶

L'elenco degli spot si costruisce direttamente sull'immagine caricata. Il riquadro dell'immagine usa la navigazione standard della vista immagine di ReciPro per spostare/zoomare; per la modifica degli spot si aggiungono le combinazioni seguenti.

Scorciatoia	Azione
`F1`	Apre questa pagina del manuale online
Doppio clic sinistro sull'immagine	Aggiunge uno spot in quel punto (con fitting del picco)
`CTRL` + doppio clic sinistro	Aggiunge uno spot e lo contrassegna come fascio diretto (000)
Clic sinistro su uno spot	Seleziona lo spot più vicino
`CTRL` + clic destro su uno spot	Elimina lo spot più vicino
`CTRL` + tasti freccia	Sposta lo spot selezionato di un pixel
Trascinamento sinistro / centrale (area vuota)	Sposta l'immagine
Rotellina del mouse	Zoom avanti / indietro alla posizione del cursore
Trascinamento destro di un riquadro	Zoom avanti sulla regione selezionata
Doppio clic destro	Zoom indietro
Doppio clic sull'intestazione di riga di uno spot (tabella)	Zoom su quello spot (×2)

→ Vedi 21. Scorciatoie da tastiera e mouse per una panoramica di ogni finestra.

Apre / salva un'immagine di diffrazione. È supportato lo stesso caricamento tramite trascinamento (drag and drop) di Spot ID v1, e i metadati Gatan DM3/DM4 (lunghezza di camera, lunghezza d'onda, dimensione del pixel) vengono rispettati automaticamente.

Salva ▸ Candidate list (CSV)... esporta i candidati di orientazione trovati dall'indicizzazione e Copia ▸ Candidate list (TSV) copia la stessa tabella negli appunti: una riga per candidato × grano, con il rango, l'indice del grano, il nome del cristallo, gli angoli di Eulero ZXZ (°), i nove elementi della matrice di rotazione, il residuo quadratico medio (nm⁻²), il numero di spot assegnati e le assegnazioni spot → (hkl). Il CSV usa sempre il punto come separatore decimale; il TSV si incolla direttamente in un foglio di calcolo.

Ottica¶

Sorgente incidente¶

Selezionare il tipo di radiazione (raggi X / elettrone / neutrone) e impostare l'energia o la lunghezza d'onda.

Lunghezza di camera / Dimensione del pixel¶

La lunghezza di camera (mm) e la dimensione del pixel del rivelatore (mm o nm⁻¹). Quando viene caricato un file Gatan DM, questi valori vengono compilati dall'intestazione del file.

Informazioni sullo spot¶

Rileva & adatta spot: Rilevamento automatico degli spot mediante massimi locali e sottrazione del fondo.
Numero: Il numero massimo di spot da rilevare.
Primo vicino: La separazione minima (px) consentita tra gli spot rilevati. I picchi più vicini di questo valore vengono uniti, impedendo la doppia rilevazione dello stesso spot.
Raggio adattam.: Il raggio (px) della regione circolare usata per fittare il picco di ogni spot. I pixel all'interno di questo cerchio vengono fittati con una funzione pseudo-Voigt.
Applica a tutti: Imposta il raggio di fitting di ogni spot al valore corrente di Raggio adattam..
Elimina / Cancella tutto: Rimuove lo spot selezionato oppure tutti gli spot rilevati.
Copia: Copia le posizioni e le intensità degli spot negli appunti.
Adattamento globale: Esegue un fit globale di tutte le posizioni degli spot contemporaneamente (sperimentale).
Donut: Applica una sottrazione del fondo a forma di ciambella (sperimentale); la casella adiacente imposta la larghezza (px) dell'anello attorno a ciascuno spot la cui media viene sottratta come fondo locale.
Dettagli spot: Se selezionato, apre una finestra che mostra informazioni dettagliate sullo spot attualmente selezionato.

Index¶

Identifica spot: Esegue l'algoritmo di indicizzazione per trovare il cristallo e l'asse di zona che meglio corrispondono.
Errore accettabile: Imposta la deviazione accettabile nella distanza interplanare e nell'angolo per una corrispondenza.
Ignora riflessioni proibite: Se selezionato, le riflessioni vietate da assi elicoidali e piani di scorrimento vengono trattate come non necessariamente soddisfatte durante la ricerca dell'asse di zona.
Grano singolo / Grani multipli: Cerca un singolo orientamento (monocristallo) oppure più orientamenti (una regione policristallina / multigrano). Per più grani, Max. num. of grains imposta il limite superiore al numero di grani da cercare.
Results: Le migliori corrispondenze vengono visualizzate con il nome del cristallo, l'asse di zona [uvw] e gli indici dei singoli spot (hkl).

Miglioramenti rispetto a v1¶

Migliore gestione del rumore nel rilevamento degli spot.
Algoritmi di fitting più robusti con molteplici forme di profilo.
Indicizzazione più rapida con algoritmi di ricerca ottimizzati.
Supporto per spot sovrapposti e riflessioni satelliti.