Spot ID v1¶

Spot ID v1 detecta, ajusta e indexa reflexões de difração a partir de imagens experimentais de difração de elétrons. Também oferece suporte à busca manual de eixo de zona a partir de uma geometria de reflexões inserida numericamente (o antigo TEM ID).

Atalhos de teclado e mouse¶

O Spot ID v1 recebe a geometria das reflexões como entrada numérica (o antigo fluxo de trabalho TEM ID), e a detecção/ajuste das reflexões é controlado por botões; a imagem de difração é exibida apenas como referência e não responde a cliques (o zoom com o mouse e a seleção manual de reflexões pertencem ao Spot ID v2). O único atalho está na janela de resultados:

Atalho	Ação
`F1`	Abrir esta página do manual online
Clique duplo em uma linha da lista de resultados	Selecionar esse cristal e girá-lo até o eixo de zona correspondente

→ Consulte 21. Atalhos de teclado e mouse para uma visão geral de todas as janelas.

Área principal¶

Exibe a imagem de difração como referência. Carregue as imagens por arrastar e soltar ou pelo menu File.

Ajustes de imagem¶

Configuração	Descrição
Min / Max	Faixa de brilho (também ajustável pela barra deslizante)
Gradient	Positivo ou Negativo
Scale	Linear ou Log
Colour	Escala de cinza ou Cold-Warm
Dust & Scratch	Remover pixels excepcionalmente claros/escuros (definir a faixa e o limiar)
Gaussian blur	Aplicar desfoque (faixa em pixels)

Optics¶

Insira a fonte incidente, energia/comprimento de onda, comprimento de câmera e tamanho do pixel do detector.

Se um arquivo dm3/dm4 (Gatan Digital Micrograph) for carregado, esses valores são definidos automaticamente.

Detecção e ajuste de reflexões¶

Pressione Detect & fit spots para detectar automaticamente as reflexões de difração e ajustá-las com uma função Pseudo-Voigt 2D. Os resultados aparecem na tabela.

Opções de detecção¶

Parâmetro	Descrição
Number	Número máximo de reflexões a detectar
Nearest neighbour	Distância mínima entre as reflexões detectadas
Fitting range	Raio (pixels) ao redor de cada reflexão para o ajuste

Controles da tabela¶

Botão	Ação
Reset range	Redefinir a faixa de ajuste para todas as reflexões
Show label/symbol	Sobrepor rótulos/símbolos na imagem
Clear all spots	Remover todas as reflexões
Save / Copy	Exportar a tabela em formato separado por tabulações (Excel)
Re-fit all	Reajustar todas as reflexões

Janela de detalhes da reflexão¶

Marque a caixa para abrir uma janela de detalhes que mostra a reflexão selecionada (à esquerda) e os perfis em quatro direções (à direita). Azul = dados observados, vermelho = ajuste.

Index¶

Pressione Identify spots para indexar as reflexões detectadas contra o cristal selecionado na Janela principal.

Configuração	Descrição
Acceptable error	Tolerância para a indexação
Single grain / Multi grains	Indexar como cristal único ou como vários grãos (definir a contagem máxima de grãos)
Show label/symbol	Sobrepor os rótulos indexados na imagem
Refine thickness and direction	Aplicar a teoria dinâmica (método de Bethe) para refinar a espessura da amostra e a orientação do cristal que melhor correspondem às intensidades detectadas

Busca de eixo de zona a partir da geometria das reflexões (antigo TEM ID)¶

Quando você não tem uma imagem para carregar, ainda é possível buscar eixos de zona candidatos inserindo manualmente a geometria de um padrão de difração de elétrons de área selecionada (SAED). Insira as condições de observação do TEM e a geometria das reflexões e, em seguida, pressione Search zone axes para encontrar orientações de cristal candidatas.

TEM condition¶

Insira as condições de observação do TEM (tensão de aceleração, comprimento de câmera, etc.).

Photo 1, 2, 3¶

Insira a geometria das reflexões de difração.

Para inserir a distância entre reflexões no detector, use a caixa mm.
Se você conhece o valor de d, insira-o nas unidades Å ou nm⁻¹.

Three sides mode : Insira os comprimentos dos três lados de um triângulo que tem o direct spot como um dos vértices.

Two sides and an angle mode : Insira os comprimentos de dois lados (incluindo o direct spot) e o ângulo entre eles.